En Daregg ha decidit posar en marxa l'atac definitiu per acabar d'una vegada amb les Tortugues que li impedeixen convertir-se en l'amo de tot l'univers. Per derrotar el seu malvat enemic, en Raphael, en Michelangelo, en Leonardo i en Donatello es veuran obligats a viatjar fins al Tecnòdrom per recuperar l'antic cos d'androide d'en Krang.